Лише стосовно до V ст. можна говорити і про народження історіографії: на зміну іонійським логографам приходять історики. Сучасні дослідники ставлять народження історії як науки в зв'язок з оформленням демократії і відповідно поглибленням політичної свідомості громадянства. Громадянин, що створює своєю політичною діяльністю сучасну історію, хотів знати і історію, яку творили його предки. Саме тому вершиною грецької історіографії стала суворо раціоналістична праця Фукидіда. Перехідною ланкою від логографів до Фукидіда можна вважати Геродота, якого Цицерон назвав «батьком історії». Біографія його відома тільки в самих загальних рисах. Народився він близько 481 р., помер між 431–425 рр. Взявши участь в боротьбі проти тиранії в рідному полісі, Геродот був вимушений покинути Галікарнас. Він багато подорожував, відвідавши Персію, Скифію, Єгипет, поки не влаштувався в Афінах, де став другом Перикла і Софокла. Основна тема «Історії» Геродота – греко-персидські війни. Композиційно праця ділиться на дві частини: перша представляє як би введення, що розрослося, в якому нарівні з власне історичним сюжетом дуже велике місце займають географічні і етнографічні екскурси, присвячені окремим країнам, об'єктам персидської агресії, так звані логоси. Ясно виділяються мідійський, єгипетський, скіфський, лівійський, фракійський логоси. Друга частина, головна, присвячена власне історії греко-персидських воєн: ионийському повстанню, походу Дарія, походу Ксеркса. Обривається виклад описом битви при Сесті. У цю частину також включені численні відступи. Жадібна цікавість освіченого іонійського грека фіксує багато що – дивні випадки, випадки з життя великих людей, дивні звичаї варварських народів, різні споруди, незвичайних тварин і т. д. До інших народів, в тому числі персів, Геродот відноситься без всякої ворожості, що спонукало Плутарха навіть звинуватити його в любові до варварів. Разом з тим вся його праця пронизана глибоким переконанням в справедливості боротьби греків, упевненістю в перевазі грецького образу життя, схилянням і захопленням Афінами – спасителями Еллади.

Праця Геродота представляє по своїй суті органічне злиття власне історичного дослідження і літературної розповіді. Його джерела обширні і різноманітні – від свідоцтв літературної традиції до особистих спостережень. При всій довірливості Геродота йому не чужі і прийоми критики джерела. Хоч на першому плані в поясненні причин історичних подій у нього стоїть діяльність окремих людей, Геродот досить виразно усвідомлює і деякі глибинні причини подій. Основною причиною греко-персидських воєн він вважає зіткнення двох завойовних політик.

Темою праці Фукидіда стала історія Пелопонесської війни. Корінний афінянин, пов'язаний родством з сім'єю Кимона, блискучий учень софістів, Фукидід був видним представником верхівки афінського поліса. Однак його кар'єра раптово обірвалася в 424 р., коли він, будучи стратегом, потерпів поразку біля Амфіполя і був вигнаний з Афін. Праця Фукидіда – це сучасна йому історія. Тільки на самому початку він дає в дуже короткій формі загальний нарис історії Еллади з найдавніших часів, весь інший зміст суворо обмежено поставленою задачею. Джерела Фукидіда вельми обширні, вигнання дозволило йому ознайомитися з матеріалами, що походять з обох таборів. Фукидід сам брав участь у війні, він приводить справжні тексти договорів, написи, використовує праці попередників, нарешті, він збирав відомості від безпосередніх учасників подій, що описуються або від осіб, що близько до них стояли. Фукидід свідомо протиставляв свій метод методу своїх попередників – логографів і Геродота. Його можна вважати родоначальником історичної критики: «Що ж до тих, що мали місце протягом війни подій, то я не вважав згідним зі своєю задачею записувати те, що дізнавався від першого зустрічного, або те, що я міг передбачати, але записував події, очевидцем яких був сам, і те, що чув від інших, після точних, наскільки можливо, досліджень відносно кожного факту, нарізно взятого».[10] Фукидід свою задачу бачить в тому, щоб створити правдиву історію Пелопонесської війни. Він прагне виявити політичні сили і зробити зрозумілим своєму читачеві хід історичних подій. Відкидаючи все чудесне (що займало таке значне місце в праці Геродота), Фукидід намагається пояснити те, що відбувалося тільки «природою людини». Тим самим природничонауковий метод переноситься їм в сферу політичної історії. Фукидід, як вже відмічалося, розрізнює об'єктивні причини війни і її безпосередні мотиви. Перші він ставить в зв'язок з незмінною природою людини, одна з найважливіших рис якої – постійне прагнення пригноблювати навколишніх. У цьому, на думку Фукидіда, полягає загальний закон історичного розвитку і відповідно глибинна причина всіх подій. Згідно з природою людини діють і колективи людей, тому за всіма політичними подіями можна бачити раціональне, логічне. Однак історія, з точки зору Фукидіда, не є механістичним процесом, пізнаваним на основі логічного аналізу, бо діють і сліпі сили (стихійні події, непередбачений збіг обставин – словом, все те, що входить у поняття «сліпий випадок»). Взаємодія раціонального і ірраціонального і утворює реальний історичний процес.

Значну роль відводить Фукидід і видатним політичним діячам, особливо виділяючи їх здатність усвідомити напрям історичного процесу і діяти відповідно до нього. До числа таких діячів він відносить Фемистокла і Перикла. З іншого боку, політичні діячі, які не усвідомлюють цього, діють в історії деструктивно (наприклад, Клеон). Політичні погляди Фукидіда –