Джордано Бруно відкрито відстоює свої переконання. У Венеції він бере в учні деякого патриція, таємним бажанням якого було придбати від Бруно якісь особливі магічні пізнання. Не одержавши їх, учень робить зрадництво - приводить у будинок учителя капітана інквізиції. Бруно арештований і відправлений у в'язницю. Від колишнього учня посипалися доноси - один гірше іншого.

Багато чого довелося говорити у своє виправдання. "Я учу нескінченності вселеної як результату дії нескінченної божественної сили, тому що було б негідно Божества обмежитися створенням кінцевого світу, у той час як воно має можливість діяти всі нові і нові незліченні світи. Я затверджую, що існує нескінченна безліч світів, подібних до нашої землі, що я уявляю собі, як і Пифагор, у виді небесного тіла, схожого на Місяць. Планети й інші зірки. Усі вони населені, нескінченна безліч у безмежному просторі утворить всесвіт. В останній існує загальне Провидіння, завдяки якому все живе росте, рухається і процвітає у своєму удосконалюванні. Це провидіння чи свідомість, що я розумію в подвійному змісті: по-перше, на зразок того, як виявляється душа в тілі, тобто одночасно в цілому й у кожній окремій частині; таку форму я називаю природою, чи тінню відображенням Божества. Потім свідомості присуща ще інша форма прояву у всесвіті і над уселеної, саме не як частина, не як душу, а іншим, незбагненним для нас образом".

Під Духом Святим, пояснив Бруно на допиті, він розуміє душу всесвіту. Від Святого Духа зглянеться все живе - життя і душа. Вона також безсмертна, як незнищувана плоть. Життя є розширення, смерть - стиск живої істоти. Бруно увесь час наполягає, що всі, чому він учив, він учив як філософ, а не як теолог, і догматів церковних не стосувався ніколи.

Його відповіді на питання інквізиції нагадують відповіді на уроках катехізису. Однак судді цим не задовольняються. Інквізитор попереджає, що якщо обвинувачуваний стане завзято відмовлятися від усього, у чому згодом він може бути викритий, то йому чогось буде дивуватися, якщо інквізиція у відношенні його удасться до законних засобів, що надані їй застосовувати до усім, хто не хоче пізнати милосердя Божие і християнську любов цієї святої установи, і які призначені до того, щоб находящихся в пітьмі звертати до світла, а збилися з щирого шляху - на шлях вічного життя.

Судді стали загрожувати, і Бруно йде на поступки. Він обіцяє відкинути всі помилки і надалі не допускати їх; він кається у вчиненому і благає, зглянути до його слабості, дозволити йому повернутися в лоно церкви і випробувати на собі милість Божию.

Джордано Бруно був переданий на судилище Римської інквізиції, тому що венеціанська інквізиція не насмілилася виносити вирок, що напевно не привів би до багаття.

27 лютого 1593 року 45 років від роду Джордано Бруно був перевезений у Рим. Йому був доданий ранг вождя єретиків, і вирок був визначений. Причому судді прекрасно усвідомлювали, що судять вони найвищою мірою ерудовану людину.

Бруно мав намір повторити своє зречення й у Римі. Але його понад шість років млоїли у в'язниці, хоча звичайно такі справи робилися швидко. Від нього вимагали зречення від своїх поглядів без усяких застережень. Але чи може Світло служити пітьмі, не погибнув? Бруно не міг отрешиться від усього, що складало саму суть його. В'язниця лише зміцнила його. Він не зміг відмовитися від своєї філософії, тому що це означало б змінити Істині. Він лише в релігійних почуттях готовий був зробити поступки своїм суддям.

Сам він писав: "Хоробро боров я, думаючи, що перемога досяжна. Але тілу було відмовлено в силі, властивому дусі, і зла доля разом із природою придушували мої прагнення... Я бачу, що перемога є справу долі... Сили мої спрямовані на те, щоб заслужити визнання майбутнього".

"Є люди, у яких любов до божественної волі так велика, що їх не можуть похитнути ніякі чи погрози застращивания. Той, хто піклується ще про свою плоть, не може почувати себе в спілкуванні з Богом. Лише той, хто мудрий і доброчесний, може бути цілком щасливий, тому що він більш не почуває страждань". Бруно відмовився від своїх колишніх зречень.

20 січня 1600 року відбулося заключне засідання в справі Бруно. 9 лютого був відправлений у палац великого інквізитора Мадручи, і там він був позбавлений священникового сану і відлучений від церкви. Після цього його зрадили світській владі, доручаючи їм піддати його "самому милосердному покаранню без пролиття крові". Така була лицемірна формула, що означала вимогу спалити живим.

Бруно тримав себе з незворушним спокоєм і достоїнством. Тільки один раз він порушив мовчання: "Бути може, ви вимовляєте вирок з більшим страхом, чим я його вислуховую". На 12 лютого було призначене виконання вироку, але воно не відбулося. Інквізиція усе ще сподівалася, що Бруно відмовиться від своїх поглядів. Але Джордано Бруно сказав: "Я вмираю мучеником добровільно і знаю, що моя душу з останнім подихом піднесеться в рай" .

17 лютого. День страти. Ні одного благання, жодного стогону не вирвалося з грудей Джордано Бруно.