Для здійснення державного управління та контролю в галузі використання водних ресурсів урядом України було затверджено цілу низку державних програм. Серед них Національна програма екологічного оздоровлення басейну Дніпра та поліпшення якості питної води (1999 p.) Національна програма екологічного оздоровлення басейну Дніпра та поліпшення якості питної води http://www.nature.org.ua/dnipro/nacprouk.htm, звіти про виконання якої регулярно публікуються і розміщуються в Інтернеті Виконання Національної програми екологічного оздоровлення басейну Дніпра та поліпшення якості питної води 2002 http://www.nature.org.ua/dnipro/infodnipro2002.htm, Виконання Національної програми екологічного оздоровлення басейну Дніпра та поліпшення якості питної води 2001 http://www.nature.org.ua/dnipro/zv2001.htm, Виконання Національної програми екологічного оздоровлення басейну Дніпра та поліпшення якості питної води 1999 http://www.nature.org.ua/dnipro/zvit1999.htm, готуються державні програми екологічного оздоровлення басейнів річок Сіверський Донець та Дністру, також готується Національний план дій з екологічного оздоровлення басейну ріки Дніпро, основні положення якого окреслено в статті Грищенко А.В., Масенко О.Г. Основні положення Національного плану дій з екологічного оздоровлення басейну ріки Дніпро Грищенко А.В., Масенко О.Г. Основні положення Національного плану дій з екологічного оздоровлення басейну ріки Дніпро. Вода та водоочисні технології. №3, вересень, 2004. С.11-15. .

Питанню управління водними ресурсами присвячено наступні статті:

Кузіна А.К. Вопросы разработки и реализации общегосударственных программ экологического оздоровления речных бассейнов. Кузин А.К. Вопросы разработки и реализации общегосударственных программ экологического оздоровления речных бассейнов. Матеріали ІІ Міжнародного Водного форуму „Аква-Україна-2004”. С.56-57. С.41-42.

Яцик А. Значення водних ресурсів Дніпра для розвитку економіки України Яцик А. Значення водних ресурсів Дніпра для розвитку економіки України.. Рідна природа. №1, 2004. С.53-54..

Бабич М., Дезірон О., Крученюк Василь. Перерозподіл стоку та забезпечення водними ресурсами маловодних регіонів України Бабич М., Дезірон О., Крученюк Василь. Перерозподіл стоку та забезпечення водними ресурсами маловодних регіонів України. Рідна природа. №1, 2004. С.55-57.,

Ganna Gerasymenko, Viacheslav Manukalo The Problems of Development of Water Resources Management in UkraineGanna Gerasymenko, Viacheslav Manukalo The Problems of Development of Water Resources Management in Ukraine. http://www.siwi.org/waterweek2003/Workshop%202B%20Poster(14).htm 

Було розроблено і затверджено загальнодержавну програму охорони та відтворення довкілля Азовського і Чорного морів (2001 р.)Загальнодержавна програма охорони та відтворення довкілля Азовського і Чорного морів, "Програму розвитку водопровідно-каналізаційного господарства" (1997 p.) Програма розвитку водопровідно-каналізаційного господарства . Йде підготовка Загальнодержавної програми «Питна вода в Україні» Загальнодержавна програма Питна вода в Україні, основним завданням якої є:

надання споживачам якісних послуг питного водопостачання та водовідведення за економічно обґрунтованими тарифами;

зниження рівня забруднення джерел питного водопостачання;

підвищення ефективності і надійності функціонування систем питного водопостачання та водовідведення за рахунок здійснення водоохоронних, технічних, фінансово-економічних та інших заходів, у тому числі створення нормативних запасів питної води на випадок надзвичайних ситуацій;

розробка технічних систем і обладнання, у тому числі мобільних, з очищення забруднених та високомінералізованих вод для питного водопостачання;

удосконалення нормативно-правової та науково-технічної бази у сфері питного водопостачання та водовідведення;

розроблення економічного механізму стимулювання ощадливого використання питної води та енергоресурсів.

Програма обговорювалася на громадських слуханнях. З результатами громадських слухань, які проводила Всеукраїнська екологічна неурядова організація „МАМА-86” можна ознайомитись на веб-сайті організації .

Кабінетом Міністрів у 2000 році схвалено Національний план дій з гігієни довкілля на 2000-2005 pp., в якому проблемам якості воли присвячено окремий розділ Національний план дій з гігієни довкілля ПДГД . Відповідно до цього плану, органи державної виконавчої влади, місцевого і регіонального самоврядування зобов'язуються забезпечити населення питною водою, якість і кількість якої повинна відповідати вимогам санітарних норм і державного стандарту.

Одним із важливих питань є питання моніторингу. Згідно з постановою Кабінету Міністрів України від 30 березня 1998 р. № 391 "Про затвердження Положення про державну систему моніторингу довкілля" Положення про державну систему моніторингу довкілля контроль за якістю води водних об’єктів у межах покладених на них повноважень постійно здійснюють наступні уповноважені органи Табл. 1.

Мінприроди | Скидання стічних вод (вміст забруднюючих речовин, у тому числі радіонуклідів), стан поверхневих вод (вміст забруднюючих речовин, у тому числі радіонуклідів) та водних об’єктів у межах природоохоронних територій (фонова кількість забруднюючих речовин, у тому числі радіонуклідів); річкових, озерних, морських вод (гідрохімічний та гідробіологічний аналіз, вміст забруднюючих речовин, у тому числі радіонуклідів); підземних вод (гідрогеологічний та гідрохімічний аналіз складу і властивостей, у тому числі залишкової кількості пестицидів та агрохімікатів, оцінка ресурсів);

Держкомприродресурсів | підземних вод (гідрогеологічні та гідрохімічні визначення складу і властивостей, у тому числі залишкової кількості пестицидів і агрохімікатів, оцінка ресурсів);

МНС | на територіях, підпорядкованих Адміністрації зони відчуження і зони безумовного (обов’язкового) відселення, а також в інших зонах радіоактивного забруднення унаслідок аварії на Чорнобильській АЕС – стан поверхневих і підземних вод (вміст забруднюючих речовин, у тому числі радіонуклідів), джерела скидання стічних вод (вміст забруднюючих речовин, обсяги скидів);

МОЗ | (у місцях проживання і відпочинку населення) – стан поверхневих вод суші і питної води (хімічний, бактеріологічний, радіологічний, вірусологічний аналіз);

Мінагрополітики | станом поверхневих вод сільськогосподарського призначення (токсикологічний та радіологічний аналіз, залишкова кількість пестицидів, агрохімікатів і важких металів);

Держводгосп | (водогосподарські системи комплексного призначення, системи міжгалузевого та сільськогосподарського водопостачання в зонах впливу атомних електростанцій) – стан річок, водосховищ, каналів, зрошувальних систем, водойм у зонах впливу автомних електростанцій (вміст радіоактивних речовин), поверхневих вод у прикордонних зонах і місцях їх інтенсивного виробничо-господарського використання (вміст забруднюючих речовин);

Держжитлокомунгосп | стан питної води в централізованих системах водопостачання (вміст забруднюючих речовин, обсяги споживання), стічних вод міської каналізаційної мережі та очисних споруд (вміст забруднюючих речовин, обсяг надходження).

З 1996 року Міністерство охорони навколишнього природного середовища України