Щоб краще зрозуміти механізм дії лікарських препаратів на ферментні системи, корисно розглянути, як працюють деякі інгібітори ферментів. Багато інгібіторів зв'язуються з активним центром ферменту – тим самим, з яким взаємодіє субстрат. У таких інгібіторів найважливіші структурні особливості близькі до структурних особливостей субстрата, і якщо в реакційному середовищі присутній і субстрат і інгібітор, між ними спостерігається конкуренція за скріплення з ферментом; при цьому чим більше концентрація субстрата, тим успішніше він конкурує з інгібітором. Інгібітори іншого типу індукують в молекулі ферменту конформаційні зміни, до яких залучаються важливі у функціональному відношенні хімічні групи. Вивчення механізму дії інгібіторів допомагає хімікам створювати нові лікарські препарати.