Лікування циститу починається з призначення постільного режиму у гострий період захворювання, зігріваючих процедур (сидячі ванночки з відваром трав, грілка на ділянку сечового міхура), фізіотерапевтичних заходів (УВЧ, НВЧ на ділянку сечового міхура, електрофорез із 33%-м розчином аспірину та ін.). Дієта повноцінна, із виключенням екстрактивних страв, багата на питво (мінеральні води, настої трав). Доцільним є використання антибактеріальних, уроантисептичних препаратів з урахуванням нефротоксичності та чутливості мікрофлори сечі. Курс лікування 10–14 дн (при затяжному перебігу — до 3 тиж). Застосовують антибіотики широкого спектра дії, нітрофурани, препарати налідиксової кислоти, сульфаніламіди. При больовому синдромі — анальгін, но-шпа, беладона у свічках, електрофорез із новокаїном на ділянку сечового міхура. Фітотерапія використовується на будь-якій стадії захворювання. У гострому періоді не проводяться інстиляції з лікарськими препаратами. Терапія хронічного циститу, який є, як правило, вторинним, спрямована на лікування основного захворювання, на усунення причин, що викликали хронічний процес. Пропонується тривале призначення антибактеріальних препаратів (до повної санації сечі), імунокоректорів, вітамінів А, В1, В6, Е, фізіо-процедур, інстиляцій лікарських препаратів залежно від морфологічного варіанта циститу. Обов’язковою є санація хронічних осередків інфекції, фітотерапія.

Профілактика включає комплекс заходів, спрямованих на запобігання та своєчасне лікування гострих інфекційних захворювань, на раннє виявлення та лікування природжених уропатій, які сприяють виникненню та збереженню інфекції у сечовому міхурі. У зв’язку з цим діти із вторинним циститом перебувають на постійному диспансерному обліку у нефролога й уролога. За дітьми, які перенесли первинний гострий цистит, спостерігають протягом 12 міс (щомісячний контроль аналізів сечі; 1 раз на квартал — визначення бактеріурії тощо).