Коменській прилучився до цього напряму в студентські роки.

Роль Альстреда у формуванні филосовских переконань Коменського дуже велика. Альстред був автором цілого ряду филосовских праць, і виявляв критичексое відношенню до догматичного тлумачення вчителя. Він дотримувався прогресивних поглядів на значення науки. Альстред вважав, що вивчення природи повинне служити на благо людини, і відбуватися за допомогою спостереження і дослідів. Сукупність багатьох дослідів створює індукцію, що є матір'ю науки. Ці передові для свого часу ідеї зробили сильний вплив на погляди Коменського.

В університетські роки Коменській знайомиться з філософською літературою, вивчає Платона, Арістотеля, Цицерона і інших великих античних філософів. В 1613 року він пише записи до одного з диспутів і називає їхні «Спірні питання, зібрані в саду філософії». Основним питанням в цих записах є питання про джерела і шляхи пізнання.

Це питання він ставить і в роботі чи «Бере всяке пізнання витік з відчуття», яка була опублікована в 1914 р.

Можна сказати, що пагсофические ідеї Коменського своїми витоками сходили до періоду навчання в Герборнськом університеті. За час навчання тут він написав окремі розділи до запланованої в об'ємі двадцяти восьми томів роботи «Видовище всесвіту»; провів плідну діяльність в області вивчення рідної мови - «Скарби чеської мови», і під керівництвом Альстреда він познайомився з працями педагогічного характеру.

В лютому 1613 року Коменській закінчує Герборнській університет і їде до Амстердама, а через невколько місяців зараховується в знаменитий

Гейдельбергській університет. Про цей період навчання збереглося мало відомостей.

Навесні 1614 р. Коменській повертається на батьківщину. Він призначається керівником Пшеровськой братської школи.З того часу в житті коменского починається нова ера. Він з великим захопленням работрает в улюбленій школі і дуже багато робить для того, щоб полегшити навчання. Він пише такі роботи як «Правила більш легкої граматики» і «Листа до неба».

В пшеровский період своєї діяльності Коменській знайомиться з філософськими і педагогічними творами німецького вченого Іоганна

Андрее, який справив на нього враження як надзвичайно освічений, прогресивний педагог і мислитель свого часу. Особливо великий вплив на Коменського зробили дидактичні переконання Андрее, до яких надалі Коменській неодноразово звертається в своїх працях.

В 1618 р. община «Чеські брати» призначила Коменського пастрырем- проповідником в р. Фульнек в Північній Моравії, де він одночасно керував і братською школою.

Цього року він одружується на падчерці бургомістра міста Пшерова

Магдалиною Візовськой, яка стала Коменському великим другом і помічником.

Відомо, що Коменській багато зробив для підвищення рівня і добробуту населення Фульнека, особливе бідняків і здійснив великі зміни у Фульнекськой школі. Фульнекс модно вважати найбільш значним в розвитку педагогічного навчання Коменського.

Після того, як Габсбурги в 1620 р. перемогли в битві в Білої гори і стратили багато патріотів, а потім добралися до Фульнека, Коменському як активному протестанту виявилося небезпечно залишатися тут. З цієї миті починається важкий період скитаний і життя в нелегальних умовах.

Лихо за лихом наздоганяло Коменського. В 1621 р. у Фульнеке католики спалили будинок Коменського з його численною бібліотекою і цінними рукописами. А в

1622 р. занесена іспанськими військами чума понесла життя його дружини Магдалини і обох дітей.

Проте ж душевна травма, викликана цим горем не змогла зламати волю великого патріота і своїм особистим прикладом він вселяв в таких же многострадальных співвітчизників дух бадьорості і непримиренності.

Коменській покидає Моравію і ховається в маленькому р. Брандісе, де пише роман-трактат філософсько-соціального напряму «Лабіринт світла і рай серця».В цій роботі він критикує феодальні відносини і феодальне суспільство.

В 1624 р. в Брандісе Коменській познайомився з дочкою єпископа Марієй-

Доротєєй і одружувався на ній. До браку Доротея брала участь в таємній роботі общини братів, а зв'язавши свою долю з Коменськім, стала одним з активних діячів цього руху.

Навесні 1625 р. Коменського відправляють до Польщі для з'ясування можливості притулку чехам в цій країні. Після повернення Коменській веде пропаганду про звільнення вітчизни.

Влітку 1626 р. Коменській з дружиною і тестем ховаються в Північно-

Східної Чехії, в Біле-Тржемешне в замку чеського поміщика Іржі

Садовського. Тут він пише дидактичну роботу на чеській мові, яка визначила круг основних питань дидактики і їхнє розв'язання у «Великій дидактиці».

31 липня 1627 р. імператор Фердинанд II проголосив католичство офіційною релігією. В указі протестантам пропонувалося поміняти релігію або покинути Чехію. Багато чим патріотам довелося залишити батьківщину і перебратися до Польщі.

8 лютого 1628 р. Коменській поселився в польському місті Лешно, яке відвіку служив притулком для «Чеських братів». В Польщі в загальній сумі Коменській проводить 28 років.

Відразу після переїзду Коменській став викладати в гімназії «братів» естествоведческие предмети, а в 1635 р. його обирають на посаду ректорує гімназії.

В ці роки Коменській проводить велику роботу по удосконаленню

"Великої дидактики", яку завершує в 1632 року.

Паралельно з роботою над «Великою дидактикою» Коменській пише підручник латинської мови «Відкриті двері мов і всіх наук», який виробив переворот в системі викладання цього важливого предмета.

В 1633-1638 рр. Коменській продовжує роботу над «Великою дидактикою» і вирішує видати її на латинській мові, щоб вона була доступна для всіх народів. Але спочатку він відправляє рукопис своєму другові Іоахиму Гюбнеру, попросивши його виказати свою думку про цю роботу. Отримавши негативний відгук Коменській довгий час утримувався від видання «Великої дидактики».

Тільки через 20 років вона була опублікована в Амстердамі в повному зібранні дидактичних творів. Ця класична робота Коменського - основоположна праця наукової педагогіки і вона перевдена