По-четверте, наслідком накопичувальної роботи є розвиток теоретичного компонента біологічного пізнання — вироблення понять, категорій, методологічних установок, створення перших теоретичних концепцій, покликаних пояснити фундаментальні характеристики живого. Насамперед це стосувалося природи індивідуального розвитку організму, у поясненні якої склалося два протилежних напрямки — преформізм і епигенез.

Преформісти (Дж. Ароматари, Я.Сваммердам, А. ван Левенгук, Г.В. Лейбниц, Н. Мальбранш і ін.) виходили з того, що в зародковій клітці вже містяться всі структури дорослого багатоклітинного організму, тому процес онтогенезу зводиться лише до кількісного росту всіх предобразованних зачатків органів і тканин Преформізм існував у двох різновидах: овистической, відповідно до якої майбутній дорослий організм предобразован у яйці (Я. Сваммердам, А. Валлисниери й ін.), і анималькулистской, прихильники якої думали, що майбутній дорослий організм предобразован у сперматозоїдах (А. ван Левенгук, Н. Гартсекер, И. Либеркюн і ін.).

Уходящая своїми коренями в аристотелизм, теорія епигенеза (У. Гарвей, Р. Декарт, питавшийся побудувати ембріологію, викладену і доведену геометричним шляхом, і ін.) цілком заперечувала яку б те ні була зумовленість розвитку організму і відстоювала точку зору, відповідно до якої розвиток структур і функцій організму визначається впливом зовнішніх факторів на непреформированную зародкову клітку. Боротьба між цими напрямками була гострої, тривалої, велася зі змінним успіхом. Кожен напрямок обґрунтовував свою позицію не тільки емпіричними, але і філософськими розуміннями (так, преформізм добре узгоджувався з креаціонізмом: Бог створив світ із усіма його істотами, що населяють, як тими, котрі були і є, так і тими, котрі ще тільки з'являться в майбутньому),

У цілому ж біологія в XVI-XVII вв. була в зародковому стані; рослинний і тваринний світи були досліджені лише в самих грубих рисах, біологічні пояснення носили чисто механічний і поверхневий характер Біологічне пізнання ще не виробило в цей час своєї власної системи методологічних установок.

У 1640 р. Джон Паркінсон публікує свою працю «Theatrum Botanicum», у якому поділяє всі рослини на 17 класів.

1. Солодкі запашні рослини.
2. Рослини, що прочищають.
3. Снотворні і шкідливі рослини.
4. Ломикаменю.
5. Цілющі трави.
6. Трави для прохолодних напоїв.
7. Рослини для гарячих напоїв і гострі пряності.
8. Зонтичні рослини.
9. Бур'янисті рослини.
10. Опушені трави.
11. Бобові.
12. Зернові.
13. Трави.
14. Болотні і морські рослини, мохи і гриби.
15. Не піддаються класифікації рослини.
16. Дерева і чагарники.
17. Екзотичні, незвичайні і несухопутні рослини.

Таксономічні одиниці і класифікація

Таксономические одиниці

Внутривидові одиниці

форма
разновидність
підвид

forma
varietas
subspecies

Основна одиниця

вид

species

Надвидові одиниці

_підрід
рід
_підсімейство
сімейство
_підрозділ
розділ
_підклас
клас
_підтип
тип
царство*

_subgenus
genus
_subfamilia
familia
_subordo
ordo
_subclassis
classis
_subdivisio, subphylum
divisio, phylum
regnum 

* Загальновизнаного визначення царства не існує

Класифікація живий

природи

Некліткові

Acellularia

Вируси
Ріккетсії

Vira
Rickettsiae

Кліткові

Cellularia

Безядерні, доядерні
Ядерні
__Рослини
__Гриби

__Тварини

Prokaryota, Archikaryota
Eukaryota, Nuclearia
__Plantae
__Mycota, Fungi
__Animalia, Zoa 

Система рослин

НИЖЧІ РОСЛИНИ

Thallophyta

типи

синьо-зелені водорості

Cyanophyta*

.

золотаві водорості
(хризофити)

Chrysophyta

.

діатомові водорості

Bicillaryophyta

.

жовто-зелені водорості

Xanthophyta

.

евгленовие водорості

Euglenophyta

.

зелені водорості

Chlorophyta

підтипи

власне зелені

Euchlorophytina

.

конъюгати

Conjugatophytina

особливий тип**

-

Glaucophyta

типи

харовие водорості

Charophyta

.

пиррофитовие водорості

Pyrrophyta

підтипи

криптофіти

Cryptophytina

.

динофити

Dinophytina

типи

бурі водорості

Phaeophyta

.

червоні водорості

Rhodophyta

особливий тип**

лишайники

Lichenomycota,
Lichenes

ВИЩІ РОСЛИНИ

Cormophyta

типи

моховидние

Bryophyta

.

папоротникообразние

Pteridophyta

.

голосеменние

Gymnospermae

.

покритосеменние

Angiospermae,
Anthophyta

класи

однодольні

Monocotyledonae

.

двочасткові

Dicotyledonae 

Царство Рослини.
а. Подцарство Багрянковие**.
1. Відділ Червоні водорості.
б. Підцарство Дійсні водорості.
1. Відділ Зелені водорості.
2. Відділ Бурі водорості.
3. Відділ Евгеленові. -
4. Відділ Діатомові.
5. Відділ Золотаві
6. Відділ Харові й ін.
с. Підцарство Вищі рослини.
1. Відділ Мохоподібні.
2. Відділ Папороті.
3. Відділ Голонасінні.
4. Відділ Покритонасінні.

ЛІТЕРАТУРА

основна:

Алексєєв Е.Б., Губанов И.А., Тихомиров В.Н. Ботанічна номенклатура. М.: Изд-во МГУ. 1989. 169 с.

Джеффри Ч. Біологічна номенклатура. М. 1980. 119 с.

Линней К. Філософія ботаніки. М.: Наука. 1989. 452 с.

Майр Е. Принципи зоологічної систематики. М.: Світ. 1971. 454 с.

International code of botanical nomenclature. 1988 і наступні роки.

додаткова:

Головкин Б.Н. Про що говорять назви рослин. М. 1986. 160 с.

Каден Н.Н., Терентьєва Н.Н. Етимологічний словник латинських назв рослин, що зустрічаються в околицях агробіостанции МГУ "Чашниково". М.: Изд-во МГУ. 1975. 203 с.

Каден Н.Н., Терентьєва Н.Н. Етимологічний словник наукових назв судинних рослин, дикоростучих і разводимих у СРСР. Вип. 1 "А". М. 1979. 267 с.

Цеглярів М.Е., Забинкова Н.Н. Російсько-латинський словник для ботаніків. Л. 1977. 855 с.

Майр Е., Линсли Е., Юзингер Р. Методи і принципи зоологічної систематики. М. 1956. 352 с.

Забинкова Н.Н., Цеглярів М.Е. Латинско-російський словник для ботаніків. М.-Л. 1966. 335 с.