взято пробу без супернатанту. При одночасному додаванні в суміш кверцетину і препарату, що містить СОД, фермент починає конкурувати з кверцетином за О2-, тому реакція окислення кверцетину уповільнюється. Чим більше препарату додавати, тим буде менша швидкість вимірюваної реакції. На основі визначень швидкості реакції при 5-8 різних кількостях препарату будується крива інгібування окислення кверцетину: по осі абсцис відкладається кількість препарату у мкл, а по осі ординат – швидкість реакції. За допомогою комп’ютерної програми “КІNЕТІСS” розраховували константу половинного інгібування (К50), яка дорівнює кількості мікролітрів препарату, при якій швидкість реакції окислення кверцетину зменшується наполовину від максимального інгібування.
Одна одиниця активності СОД відповідає кількості ферменту, який наполовину інгібує реакцію окислення кверцетину (тобто активність в 1 одиницю має СОД, що міститься в К50 мл препарату тканини).
Специфічна активність показує, скільки одиниць активності знаходиться в 1 мг білка, і розраховується за формулою:
А = 1 / (К50 [білок]),
де А – активність, Од/мг білка; К50 – константа половинного інгібування, виражена в мілілітрах, [білок] – концентрація білка в пробі, мг/мл.
2.6. Визначення концентрації білка
Концентрацію білка в пробі визначали за допомогою методу Бредфорда [11]. Даний метод ґрунтується на здатності білка зв’язуватись з барвником кумасі яскраво-голубим G-250 і утворювати забарвлені сполуки. Концентрацію білка в досліджуваних пробах розраховували за формулою:
,
де – концентрація білка, мг/мл;
– оптична густина;
– оптична густина стандартної проби, що містить “С” мкг білка;
– об’єм препарату, мкл.
Поглинання дослідних проб і проб для калібрувального графіка визначали на спектрофотометрі Spekol 221 (Німеччина) при довжині хвилі 590 нм.
2.7. Електрофорeз в поліакриламідному гелі
Електрофорез дозволяє розділити білкову суміш не тільки по заряду, а також і по розмірам і формам частинок. Ми проводили електрофоретичне розділення білків в тонкому шарі поліакриламідного гелю тому, що використання тонких пластин полегшує ефективне відведення тепла при електрофорезі. Процес фіксації, фарбування і відмивання займає значно менше часу в порівнянні з електрофорезом в трубочках. Використання однієї пластини дозволяє в абсолютно ідентичних умовах проводити розділення зразу декількох (10-13) проб білка.
В роботі ми використали два типи гелю – концентруючий і розділяючий. Спочатку в касету на висоту 85 мм від дна заливали розчин для полімеризації розділяючого гелю (7%), який містив: 2,5 мл буферу для гелю (рН 8,9), 2,5 мл акриламіду, 20 мг персульфату амонію та 20 мкл концентрованого ТЕМЕДу. На нього наносили воду і касету залишали в вертикальному стані до полімеризації гелю. Воду видаляли, на поверхню цього гелю наносили суміш для полімеризації концентруючого гелю до повного заповнення касети і вставляли шаблон-гребінку. Склад концентруючого гелю (6%): 1,75 мл буферу для гелю (рН 8,9), 1,75 мл акриламіду, 5 мг персульфату амонію та 10 мкл концентрованого ТЕМЕДу.
Електрофорез проводили при 160 В і 36 мА.
Відомий гель витримували 20 хв в 2,45Ч10-3 М розчині нітротетразолію синього для утворення О2- з О2.. Потім рідину зливали. Інгібували 15 хв в суміші, що містила такі компоненти (вказано кінцеві концентрації): 28 мкМ ТЕМЕДу, 0,028 мМ рибофлавіну, 36 мМ КФБ (рН 7,8). Гель поміщали в сухі чашки Петрі і залишали на світлі на 5-10 хв. За цей час гелі зафарбовуються в синій колір, крім зон, які мають СОД-активність (незабарвлені).
2.8. Визначення термостабільності СОД
Пробу нагрівали на водяній бані при t=45°C. Через рівні проміжки часу відбирали супернатант для визначення активності СОД, приймаючи контроль (без нагрівання) за 100%. Нагрівання СОД проводили протягом 3 год.
2.9. Інгібування СОД диетилдитіокарбаміновою кислотою
Диетилдитіокарбамінова кислота (ДДК) є інгібітором Cu,Zn-CОД. Ця речовина видаляє мідь з активного центру Cu,Zn-СОД, в результаті чого даний фермент втрачає активність. Досліджено зміну загальної активності СОД при інкубації з ДДК різних концентрацій протягом різних проміжків часу.
3. РЕЗУЛЬТАТИ ДОСЛІДЖЕНЬ ТА ЇХ ОБГОВОРЕННЯ
3.1. Очистка і активність СОД з печінки свині
За допомогою вище описаного методу висолювання було проведено ряд дослідів по частковій очистці СОД. Спочатку висолювання проводили через кожні 10% насичення. Було отримано найбільшу активність СОД в фракції 90-100% в порівнянні з контролем. Дану фракцію було поділено ще на три фракції: 90-95%, 95-100%, >100%. Найбільшу активність СОД в порівнянні з контролем було отримано у фракції 95-100% (табл. 2), що в середньому становила 475 Од/мг білка. Дана активність СОД в цій фракції перевищує її активність в контролі приблизно в 3 рази.
Табл. 2. Характеристика СОД з печінки свині.
№ досліду | Фракція, % | Конц. білка, мг/мл | Заг. білок, мг | Активність, од/мг білка
1 |
вихідний супернатант
0-20
20-30
30-40
40-50
50-60
60-70
70-80
80-90
90-100 |
26,8
25,9
17,3
16,2
11,1
11,0
7,8
1,52
1,43
1,24 |
222
218
215
179
156
142
112
28,6
27,4
22,3 |
258
74,8
30,8
36,0
30,1
129
292
418
516
1240
2 | вихідний супернатант
50-80
80-85
85-90
90-95
95-100 |
14,2
21,3
5,69
3,73
1,19
1,08 |
398
510
96,7
61,5
19,6
14,0 |
200
269
91,8
62,5
284
611
3 | вихідний супернатант
40-90
90-95
95-100
>100 |
18,3
28,6
16,9
4,09
0,62 |
458
572
228
49,1
7,44 |
252
218
348
696
347
4 | вихідний супернатант
90-95
95-100
>100 |
4,93
0,45
0,42
0,2 |
49,3
3,6
3,36
1,14 |
101
256
516
122
5 | вихідний супернатант
95-100 |
20,9
0,39 |
209
3,9 |
97,6
233
6 | вихідний супернатант
95-100 |
15,2
1,65 |
50,6
7,9 |
120
329
На мал.1 представлена типова крива інгібування швидкості окислення кверцетину СОД з печінки свині. З цього графіка видно, що для повного інгібування реакції окислення кверцетину потрібно додати тільки 5-10 мкл супернатанту з печінки свині. К50 в даному випадку дорівнювало 1,68 мкл супернатанту, а активність 611 Од/мг білка.
Мал. 1. Графік типового інгібування швидкості окислення кверцетину СОД з печінки свині (фракція 95-100%).
3.2. Електрофорез
Наступним етапом роботи було дослідити СОД на наявність ізоформ ферменту з печінки свині. Використовували метод електрофорезу в поліакриламідному гелі на пластинці. Було зроблено шість повторів. У всіх цих повторах отримали одну смугу СОД-активності, що може свідчити про те, що тут наявна одна ізоформа СОД або дуже близько розташовані смуги. На мал.2 показано форез