Ця стадія, стадія розпаду колишнього громадського порядку, на його думку охоплює період з 1300 по 1800 рік. Ідеологічною основою цього періоду стає метафізичний спосіб пояснення, суть якого полягає в абстрактно-втіленому тлумаченні суті речей і явищ без якої-небудь опори на емпірично спостережувані дані. Метафізика, пише Конт, намагається, як і теологія, пояснити внутрішню природу істот, початок і призначення всіх речей, основний спосіб утворення всіх явищ, але замість того, щоб вдаватися до допомоги надприродних чинників (як це робить теологічне мислення), вона їх все більш і більш замінює суттю або втіленими абстракціями; у метафізичній стадії умоглядна частина виявляється спочатку надзвичайно перебільшеною унаслідок наполегливого прагнення аргументувати замість того, щоб спостерігати.

Суть перехідної (метафізичної) стадії полягає у тому, що відбувається руйнування старих засад (Реформація, Освіта, революції війни і т. д.). Ціле руйнується. І хоча в цьому руйнуванні є свої позитивні моменти (емансипується особа, затверджуються нові економічні і політичні ідеали і т.д. ), все ж таки «метафізичний дух» є прояв сумніву, егоїзму, моральної зіпсованості і політичного безладу. У якійсь мірі цей ненормальний стан суспільства, який має потребу в порядку і дисципліні в нормалізації соціальної цілісності. Для цього суспільству необхідна нова інтегруюча ідеологія, яка, на думку Конта, і викристалізовується у міру розвитку наукового (тобто позитивного) знання.

Суть «позитивної» епохи, яка, на думку Конта, починається з 1800 року, полягає в корінному перетворенні розумових орієнтирів. Людська думка акцентує свою увагу не на надприродному і не на поясненні за допомогою абстрактної суті, а тільки на законах, що є спостережуваними зв'язками явищ. «У позитивному стані, - пише Конт, - людський розум, визнавши неможливість досягти абсолютних знань, відмовляється від дослідження походження і призначення Всесвіту і від пізнання внутрішніх причин явищ і цілком зосереджується, правильно комбінуючи міркування і спостереження, на вивченні дійсних законів».

З соціальної точки зору нове суспільство характеризується перемогою альтруїзму над егоїзмом, зростанням соціальних відчуттів, зміцненням порядку і соціального миру, здійснюється перехід від військового суспільства до промислово розвиненої системи. Разом з тим підкреслюється, що і в новому суспільстві є свої як позитивні, так і негативні моменти, тому задача науки полягає в тому, щоб максимально сприяти очищенню цього суспільства від негативних сторін.

Уявлення Конта про предмет і задачі соціології формувалося під впливом ліберально-консервативних поглядів. Конт в рівній мірі виступав як проти традиціоналістів, так і проти радикалів, що оголошували єдиною умовою прогресу революційне руйнування. Прагнучи подолати характерне для епохи Освіти зіставлення соціального порядку і прогресу, Конт мріяв про суспільство, в якому соціальний порядок не приводить до застою, а прогрес - до революційної анархії. Відповідно головна задача соціології розумілася їм як опис взаємодії законів функціонування і розвитку суспільства і виробітку оптимальної з цієї точки зору політики. «Основне узгодження між порядком і прогресом, - писав Конт, -составляєт ще невід'ємніша перевага позитивізму. Жодна доктрина навіть не намагалася виробити це необхідне злиття... Порядок стає... незмінною умовою прогресу, тоді як прогрес складає безперервну мету порядку». Хоча Конт не зміг розв'язати цю «вічну» проблему, він проте чітко сформулював її як центральну проблему соціології.

У концепції Конта порядок і прогрес суть різні прояви суспільного цілого. Тому предмет соціології не окремі конкретно-історичні суспільства, а суспільство в цілому, суспільство як система в його минулому і справжньому. Немає ніякого резону вивчати окремі соціальні явища поза їх зв'язком з іншими частинами суспільства, як і суспільством в цілому, бо таке вивчення втрачає своє значення. Наочна область соціології охоплює таким чином, на думку Конта, всю сукупність соціальних явищ. В результаті соціологія перетворюється на своєрідний компендіум всіх суспільних наук, стає їх теоретичною основою.

Значну увагу Конт надав розробці методів соціології. Критикуючи умоглядні міркування про методи, Конт запропонував програму систематичного вивчення дослідницької практики конкретних наук. На відміну від багатьох своїх послідовників Конт добре розумів обмеженість чисто емпіричного підходу до дослідження соціальних явищ. Він постійно підкреслював необхідність переходу від фактів до принципів і від принципів до фактів. «Якщо, з одного боку, всяка позитивна теорія необхідно повинна бути заснована на спостереженнях, то, з іншою - для того, щоб займатися спостереженням, наш розум потребує вже якої-небудь теорії».

У соціології, на думку Конта, застосовні всі основні загальнонаукові методи: спостереження, експеримент, порівняльний метод і інші, але кожний з них при цьому має свою специфіку. Як і інші науки, соціологія будує всю будівлю своєї науки на спостереженні. Конт не зумів виробити чітких критеріїв об'єктивності спостереження в соціальних науках. Проте він сформулював ряд загальних принципів. По-перше обгрунтував саму можливість використовування спостереження. Заперечуючи проти тверджень про ненадійність історичних свідоцтв, несумісності спостережень окремих учених, що дають часто протилежні описи одних і тих же фактів, Конт стверджував, що в цьому випадку слідувало б відмовитися від науки взагалі, оскільки всі вони в тій чи іншій мірі використовують такі свідоцтва і спостереження, які немає можливості повторити. Щоб бути